HiChIP技术简介
HiChIP(in situ Hi-C followed by chromatin immunoprecipitation)是一种利用原位Hi-C原理和转座酶介导构建文库来解析染质体构象的方法,用更小的数据量获取了更高分辨率的染色质三维结构信息。该方法将能够针对特定蛋白进行染色质互作构象分析,可用于研究转录因子作用机制、表观修饰对基因调控的机制
技术原理
技术优势
(1) 快速高效:该方法2天就可以完成全部实验部分内容。
(2) 信噪比高,所需细胞量少。
(3) 特异性好:细胞核中完成交联,降低了假阳性,最大化提高DNA互作的捕获效率。
(4) 与ChIA-PET相比,HiChIP构象信息读取的产量提高了10倍以上,所需的样本量降低了100倍。
方法分析展示
1. 与ChIA-PET相比,HiChIP构象信息读取的产量提高,所需的样本细胞量降低
2. HiChIP能够得到一个高信噪比的染色质相互作图
3. HiChIP方法能够得到更高的实验重复性
服务流程
样本材料要求
样本类型:活细胞,细胞数量≥1.5×107;
产生的数据量:100G
服务周期:60天